Es el fondo más importante y abundante del Archivo General Agustiniano. Consta de 15 series:

• Aa: Noticias relacionadas con las Provincias, Congregaciones y Conventos de la Orden.  Comprende 70 unidades archivísticas.
• Bb: Registros de los Procuradores Generales de la Orden. Comprende 109 unidades archivísticas.
• Cc: Miscelánea (colecciones de cartas, tratados, libros, noticias, visitas, escritos, entre otros). Comprende 110 unidades archivísticas.   
• Dd: Registros de los Priores Generales. Comprende 270 unidades archivísticas.
• Ee: Noticias de la beatificación de nuestros santos. Esta serie es actualmente gestionada por la oficina de la Postulación General de la Orden.
• Ff: Actas capitulares de todas las Provincias y Congregaciones de la Orden. Comprende 65 unidades archivísticas.
• Gg: Inventarios de celebraciones de misas. Comprende 12 unidades archivísticas.
• Hh: Bulas originales. Esta serie, muy significativa e importante par la historia de la Orden, está conformada por una cantidad considerable de pergaminos restaurados, catalogados y publicados en el Bullarium Ordinis Sancti Augustini por el P. Carlos Alonso, O.S.A.
• Ii: Relaciones económicas de varios conventos. Dentro de esta serie destaca la colección de informes de los conventos italianos del año 1650 conocido como las Relaciones Inocencianas, muy consultado por diversos investigadores y que, como bien su nombre lo indica, son producto de la petición expresa hecha por el Papa Inocencio X a los superiores mayores de los institutos religiosos de visitar e informar sobre el estado de los diversos conventos de sus comunidades. Comprende 42 unidades archivísticas.
• Kk: Catálogos de estudiantes, con registros, informes, provisiones y demás. Comprende 20 unidades archivísticas.
• Ll: Libros de entradas y salidas del depósito del Padre General. Comprende 13 unidades archivísticas.
• Mm: Libros de entradas y salidas de la Biblioteca Angélica. Comprende 10 unidades archivísticas.
• Nn: Libros de caja de nuestra religión.  Comprende 20 unidades archivísticas.
• Oo: Archivo de la Provincia Romana, principalmente inventarios y actas. Comprende 15 unidades archivísticas.
• Pp: Hermanas de vida contemplativa y de vida activa. Comprende 40 unidades archivísticas.

Este fondo está conformado por 23 series muy dispersas y fragmentadas, dado que gran parte de la documentación del Convento se encuentra en el Archivo de Estado de Roma. Comprende alrededor de 100 unidades archivísticas.

• A: Inventari, catasti e riduzioni di Messe
• B: Campioni o bilanci
• C: Istromenti originali e copie
• D: Libri di ricevute
• E: Libri per le Doti
• F: Posizioni e varie notizie
• G: Giornali e liste delle Funzione fatte in Curia
• H: Libri delle proposte
• I: Entrata ed esito del deposito del convento
• K: Entrata ed esito dei depositi dei religiosi o sia vestiarii e onorarii
• L: Inventarii delle suppellettili del convento e della chiesa
• M: Interessi spettanti alla Casa Ghirlandari
• N: Interessi spettanti ai Signori di Casa Pegni
• O: Giornali dell’entrata
• P: Giornali dell’esito
• Q: Entrata ed esito del refettorio, forno, ogliaro, cantina, pane e infermeria
• R: Libri dell’entrata ed esito delle vigne
• S: Libri dei rappezzi e fabbriche delle case e del convento
• T: Conti saldati dei muratori, ferrai, falegnami ed altri artisti
• V: Libri appartenenti alla nostra parrocchia
• X: Libri d’entrata ed esito della cappellania di S. Monica e dell’eredità Ghirlandari
• Y: Entrata ed esito della sagrestia
• aa: Documenti diversi

Los Archivos de la Congregación de Lombardía y del Convento de Santa María del Popolo se trasladaron al Archivo General de la Orden cuando la Congregación desapareció en 1912. Vale la pena resaltar que el convento de Santa María del Popolo fue la sede del Procurador General de la Congregación de Lombardía ante la Curia Romana.  Comprende 174 unidades archivísticas.

SOTTOFONDO CONGREGAZIONE LOMBARDA

• Les chroniques.
• Première série.
• Deuxième série.
• Troisième série.
• Quatrième série.

SOTTOFONDO CONVENTO S. MARIA DEL POPOLO

• Libri proprietatum conventus S. Mariae de Populo.
• Libri di ricevute.
• Libri instrumentorum seu Catastra.
• M: Miscellanea.

• P. Fr. Saturnino López, O.S.A.: Contiene 86 unidades archivísticas que conservan la documentación producida y reunida por este fraile agustino español que se interesó especialmente por la historia de la Orden acercándose a ella de manera particular a través del estudio del Bulario de la Orden.
• Fr. Prosper Grech, O.S.A.: Contiene 5 unidades archivísticas que reúnen parte de la documentación relacionada con este hermano de la Orden, biblista, asiduo profesor, escritor y uno de los fundadores del Instituto Patrístico Agustiniano de Roma, elegido como miembro del Colegio Cardenalicio por el Papa Emérito Benedicto XVI.
• P. Fr. Eelcko Ypma, O.S.A.: Está conformado por 11 unidades archivísticas que contienen parte del material documentario reunido por este fraile agustino interesado de manera especial en la historia de la Orden de San Agustín en Francia.
• Agostino Card. Ciasca, O.S.A.
• Sebastiano Card. Martinelli, O.S.A.
• P. Fr. Antonio Casamassa, O.S.A.
• S.E. Mons. Agostino Felice Addeo, O.S.A.
• S.E. Mons. Pietro Canisio Van Lierde, O.S.A.
• P. Fr. X. Martin, O.S.A.

Conformado por 23 unidades archivísticas este fondo contiene algunas piezas documentales relacionadas con datos de estudiantes, actas de capítulos de la comunidad local, libros de entradas y salidas, entre otros, de esta casa que en la ciudad de Roma ha sido centro de gobierno y casa general de estudios.

El Archivo General Agustiniano custodia diversos materiales que representan un valor patrimonial e histórico para la Orden.  Entre estos materiales se pueden destacar las siguientes colecciones:

• Cartas Rocca: Se trata de una colección particular y bastante interesante conservada en el AGA, está conformada por 126 descripciones de las ciudades de la Italia meridional y 33 plantas o mapas de ciudad, obra adelantada por iniciativa del fraile agustino Angelo Rocca, con ocasión del viaje realizado entre 1583 y 1584 con el Prior General Spirito Anguissola para la visita canónica de los conventos agustinos del sur de Italia. Esta curiosa e importante colección se encuentra digitalizada en su totalidad. 
• Biblioteca de Historia de la Orden: Manuscritos, incunables, libros litúrgicos, breviarios, constituciones, rituales, libros de coro, y otros relacionados con la historia de la Orden y de sus circunscripciones.
• Hemeroteca: Boletines oficiales, publicaciones científicas y periódicas de las circunscripciones de la Orden.
• Fototeca: Una colección bastante considerable e importante de fotografías desde el siglo XIX hasta nuestros días que constituye una fuente importante para la memoria e historia de la Orden y de sus distintas circunscripciones y realidades.
• Audiovisual: Diapositivas, filminas, cintas magnéticas, video, VHS, DVD.
• Filatélica-numismática: Una considerable colección de monedas y medallas pontificias.
• Mapoteca: Colección de planos y mapas de algunos conventos y ciudades conservados en el Archivo.
• Miscelánea: Colección de distinciones, menciones y otros objetos curiosos.